中國(guó)藥科大學(xué)的前身為國(guó)立藥學(xué)專科學(xué)校(四年制)，始建于1936年，是中國(guó)歷史上第一所由國(guó)家創(chuàng)辦的高等藥學(xué)學(xué)府。建校初期，抗戰(zhàn)爆發(fā)，學(xué)校初遷漢口，復(fù)遷重慶，精研學(xué)術(shù)，哺育英華。1946年回遷南京。1952年，齊魯大學(xué)藥學(xué)系和東吳大學(xué)藥學(xué)專修科并入學(xué)校，成立華東藥學(xué)院。1955年開始招收研究生。1956年更名為南京藥學(xué)院。1986年與籌建中的南京中藥學(xué)院合并，成立中國(guó)藥科大學(xué)。1996年進(jìn)入國(guó)家“211工程”重點(diǎn)建設(shè)的百所高校行列。2000年，學(xué)校由國(guó)家藥品監(jiān)督管理局整體劃轉(zhuǎn)教育部管理。2001年，江蘇省藥科